El COESIDA tiene como objetivos el promover y apoyar las acciones del Sector Salud y de los Sectores Público, Social y Privado tendientes a prevenir el Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida y otras Infecciones de Transmisión Sexual, así como brindar atención médica integral a la población sin seguridad social con VIH/Sida.

El CAPASITS tiene como objetivo coordinar, supervisar y vigilar que las acciones para la atención integral de las personas con VIH y otras ITS, se ofrezcan a la población usuaria de los CAPASITS bajo estándares de calidad y con un trato caracterizado por la no estigmatización ni discriminación.