El Comité de Investigación, coordinado por el Departamento de Capacitación, es uno de los cinco órganos colegiados del Consejo Estatal para la Prevención y Control del Sida en el Estado de Oaxaca, de acuerdo al decreto de creación de este último, publicado en el Periódico Oficial del 4 de julio y reformado en el Periódico Oficial del 14 de noviembre del año de 1998. Está integrado por representantes de las instituciones del sector público de la salud y seguridad social y de instituciones de educación superior públicas y privadas de la entidad.
Su objetivo general es promover, analizar y difundir las investigaciones sobre VIH/Sida que favorezcan el desarrollo del programa del COESIDA.