Esta área tiene como objetivo otorgar atención médica integral de calidad y sin discriminación ni estigmatización a las personas con infección de VIH/Sida e ITS. Entre sus funciones se encuentra informar al paciente sobre todos los aspectos relacionados a la infección por el VIH/Sida o ITS, así como su estado y pronóstico; solicitar pruebas de laboratorio de acuerdo a las guías de manejo clínico de pacientes con VIH/Sida, o de otras ITS, según el caso requiera; definir el tratamiento de acuerdo a los protocolos establecidos, tanto de medicamentos antirretrovirales como para prevenir infecciones oportunistas; informar de manera clara y sencilla a los pacientes sobre los efectos de los medicamentos que se indican; firmar responsiva como médico tratante en el expediente clínico; referir a los pacientes diagnosticados que requieran atención médica especializada de segundo nivel; llevar el control prenatal de toda mujer embarazada con VIH/Sida, solicitando los exámenes médicos para su estudio, previo consentimiento informado. Así mismo, se atiende a los recién nacidos de madres con VIH/Sida, y realizar su seguimiento periódicamente para conocer su evolución; informar a toda mujer en edad reproductiva que vive con el VIH/Sida sobre los procedimientos de planificación familiar definitivos y temporales, sin realizar coacción o presión para que decida sobre el tema; entre otras funciones.

En el Área de Atención Médica podemos encontrar consultorios de Medicina General, Medicina Especializada, Dermatología, Ginecología, Infectología, Medicina Interna, Medicina Integrada, Pediatría y Epidemiología.